با پایان لیگ بیست و سوم اخباری مبنی بر جدایی نکونام از استقلال منتشر شد که حکایت از پایان همکاری مالکان با این سرمربی داشت. با این حال اظهار نظر رسمی نکردن مسئولان باشگاه این اخبار را قوت بخشید.