او در انتخابات ۱۴۰۰ نیز نامزد انتخابات ریاست جمهوری شد ولی در نهایت به نفع سید ابراهیم رئیسی کنار رفت. نکته قابل تامل اینکه سعید جلیلی تاکنون هیچ منصب انتخابی نداشته است.