البغدادی در اکتبر ۲۰۱۹ در پی عملیات ویژه آمریکا در استان ادلب در شمال غربی سوریه کشته شد که طبق گفته دونالد ترامپ، رئیس جمهوری پیشین آمریکا، این عملیات از سوی تیم کماندویی آمریکا انجام گرفت، ولی البغدادی در آن روز، خود را به همراه دو همسر و یک پسرش، منفجر کرد.