فرآیند ساخت ‌‌‌و‌ساز در طرح ‌‌‌نهضت ملی مسکن با چالش روبه‌‌‌رو‌‌‌ خواهد شد، یکی ‌‌‌از مهم‌ترین دلایل اینکه طرح نهضت ملی مسکن با چالش مواجه خواهد شد، نادیده گرفتن معضلات اساسی کشور در طراحی و ساخت واحدهای نهضت ملی مسکن است. در حال حاضر یکی از شاخص‌‌‌ترین معضلات کشور، مساله بحران انرژی است که باید با ساخت مسکن به روش صنعتی، در جهت ساخت واحدهای مسکونی که مصرف انرژی در آنها بهینه شود گام برداشت، این در حالی است که‌‌‌ این‌‌‌ اصل مهم در طراحی و ساخت واحدهای نهضت ملی مسکن مغفول مانده است.