حکایت اتاق بازرگانی به ریاست محمدرضا نهاوندیان رسید‌و متوقف شد. چنانچه در ذکر دوران ریاست به نسبت کوتاه‌‌‌‌مدت او بر اتاق بازرگانی آمد، اتاق در دوران او ساختاری دیگر پیدا کرد. کمیسیون‌ها تشکیل شدند، کمیته‌‌‌‌ها فعال شدند، معاونت‌ها برای اتاق تعریف شد و این نهاد خصوصی نظم و نسقی پیدا کرد. منتقدان، این ساختار را ساختاری مشابه دولت می‌خواندند.