استقلال جواد نکونام خیلی‌ها را یاد استقلال فرهاد مجیدی می‌اندازد؛ تیمی که در لیگ بیست‌ویکم با بردهای اقتصادی قهرمان لیگ برتر شد. این دو تیم شباهت‌های زیادی به هم دارند. مثلا هر دو از نظر بازیکنان اسمی آن‌قدرها پرستاره به نظر نمی‌رسند، فوتبال خیلی جذاب و تماشاگرپسندی هم ارائه نمی‌کنند، اما در عین حال راه و رسم بردن و دست پر بیرون آمدن از هر مسابقه را بلد هستند. به علاوه فرهاد مجیدی هم در بخشی از دوران کارش با مدیران وقت باشگاه استقلال به‌شدت درگیر بود. با این حال بین روش کار این دو مربی دست‌کم یک تفاوت بزرگ به چشم می‌خورد؛ اینکه مجیدی پشت بازیکنانش می‌ایستاد و به آنها اعتماد به نفس می‌داد، اما نکونام خواسته یا ناخواسته در مسیر تضعیف روحیه شاگردانش گام برمی‌دارد.