یکی از اساسی ترین انتقاداتی که به نظام مالیاتی کشور در حوزه بازار مسکن از سوی منتقدان وارد می شود فرمول و نحوه محاسبه مالیات بر نقل و انتقال ملک است. مطابق با فرمول پیش بینی شده در مالیات بر نقل و انتقال، قیمت پایه مالیات، به جای اینکه قیمت روز ملک معامله شده، در نظر گرفته شود، ‌‌‌‌قیمت منطقه‌‌‌‌ای تعیین شده است.