طی توافقات صورت گرفته و موافقت مسئولان محلی در برخی از شهر‌ها دانشگاه پیام نور به دانشگاه دولتی آن شهر، آموزشگاه فنی و حرفه‌ای و یا بعضا به دانشگاه فرهنگیان اختصاص داده شده است و بسیاری از کارکنان و اعضای هیات علمی آن به سایر دانشگاه‌ها منتقل شدند.