در نشست افتتاحیه دوره ششم مجلس خبرگان رهبری آیت الله محمدعلی موحدی کرمانی ابتدا به عنوان رئیس سنی اداره جلسه را برعهده گرفت، اما در ادامه با رای ۵۵ نفر از این مجلس ۸۸ نفره، برای مدت دو سال رئیس این مجلس شد.