یگان ویژه صابرین برای اولین بار در سال ۱۳۷۹ با هدف انجام ماموریت‌های ویژه سپاه پاسداران تشکیل شد و نخستین فرمانده آن سرلشکر پاسدار محمدعلی جعفری؛ فرمانده وقت سپاه پاسداران بود.