دانشمندان معتقد هستند که ژن‌های نئاندرتال با اختلالات خلقی مانند افسردگی و بیماری‌های خودایمنی، آرتریت و التهاب مفاصل و حتی افرادی که گرایش بیشتری برای استفاده از نیکوتین دارند مرتبط هستند.