شواهد نشان می‌دهند که مایکروبیوم‌های روده از طریق ارتباط بین میزبان و محیط به‌وسیله استخراج انرژی از غذاهایی که هضم نشده‌اند، باعث افزایش متابولیسم و تولید سیتوکین‌هایی می‌شود که بر روی متابولیسم میزبان تاثیر می‌گذارند.