موزه محفوظی در دل خود آثار خطی نفیس و ارزشمندی را جای داده و به یکی از موزه‌های منحصربه‌فرد در خاورمیانه بدل شده است. این موزه خصوصی به همت و هزینه‌های شخصی دکتر محمدصادق محفوظی جمع‌آوری شده و گنجینه کم نظیری از نسخ خطی را در کنار آثار دیگر هنری و تمدنی اسلام و ایران در خود جای داده است.