دکتر باقر آیت الله زاده شیرازی ساعت 19 و پانزده دقیقه در حالی پشت تریبون قرار گرفت که در مراسم بزرگداشت خود در ۲۸ مرداد ۱۳۸۶ شرکت کرده بود.این استاد پیشکسوت رشته معماری و مرمت آثار تاریخی بعد از تلاوت آیه ای از قرآن کریم و بیان جملاتی کوتاه به طور ناگهانی دچار حمله قلبی شد و دقایقی بعد در بیمارستان دی تهران درگذشت.