خالد نبی در منطقه کوهستانی و در ۶۲ کیلومتری شمال شرق شهرستان کلاله و ۹۰ کیلومتری گنبد کاووس قرار دارد و بر فراز قله کوه گوگجه داغ واقع شده است.