باشگاه استقلال در حالی که هنوز مدیرعامل رسمی ندارد و اعضای هیات مدیره آن نیز مشخص نشده‌اند، با چالش‌های بزرگی در فصل نقل و انتقالات روبرو است. از جمله این چالش‌ها می‌توان به بلاتکلیفی در مورد تمدید قرارداد سیدحسین حسینی، شایعات مربوط به مذاکره با آندره‌آ استراماچونی و جذب ودران کیوسفسکی دروازه‌بان اهل بوسنی بدون هماهنگی با سرمربی اشاره کرد.