اولین دوره جایزه دانشمند جوان مصطفی (ص) در سال ۲۰۲۵ با منابع حاصل از وقف پروفسور امید فرخزاد، برگزیده دوره پنجم جایزه مصطفی (ص)، برگزار می‌شود.