اکبر زجاجی در مهر ۱۳۶۱، به عضویت سپاه درآمد و یک ماه پس‌ازآن، به‌عنوان جانشین معاون عملیاتی لشکر ۲۷ منصوب شد و به فعالیت پرداخت. در فروردین ۱۳۶۲ نیز به مدت چهار ماه در مقام معاون عملیاتی لشکر انجام‌وظیفه کرد و سرانجام در ۸ مرداد ۱۳۶۲، به دلیل رشادت و لیاقتش، به‌عنوان قائم‌مقام لشکر ۲۷ محمد رسول‌الله (ص) منصوب شد.