یکی از چالش‌های شرکت‌های دانش‌بنیان تامین سرمایه و نقدینگی است، زیرا دریافت تسهیلات در بسیاری از مواقع راه‌حل مناسبی برای این شرکت‌ها محسوب نمی‌شود، به سبب آنکه بازپرداخت تسهیلات با نرخ سود بالا و تامین وثایق جهت ضمانت برای شرکت‌های دانش‌بنیان که بعضاً بنگاه‌های متوسط و کوچک هستند بسیار دشوار است، بازار سرمایه نقش مهمی در به‌کارگیری نقدینگی‌های راکد و جذب آن در تامین منابع مالی مورد نیاز طرح‌های مهم، راهبردی، نوآورانه شرکت‌های دانش‌بنیان دارد.